Prosím čekejte...
stdClass Object
(
    [nazev] => Název webu / pracoviště
    [adresa_url] => 
    [api_hash] => 
    [seo_desc] => 
    [jazyk] => 
    [jednojazycny] => 
    [barva] => 
    [indexace] => 
    [obrazek] => 0001~~Cwt29gjRTcsv0vV3BwA.jpg
    [ga_force] => 
    [cookie_force] => 
    [secureredirect] => 1
    [google_verification] => 
    [ga_account] => 
    [ga_domain] => 
    [ga4_account] => 
    [gtm_id] => 
    [gt_code] => 
    [kontrola_pred] => 
    [omezeni] => 
    [pozadi1] => 
    [pozadi2] => 
    [pozadi3] => 
    [pozadi4] => 
    [pozadi5] => 
    [robots] => 
    [htmlheaders] => 
    [newurl_domain] => 'nivb.vscht.cz'
    [newurl_jazyk] => 'cs'
    [newurl_akce] => '[cs]'
    [newurl_iduzel] => 
    [newurl_path] => 8549/67607/67608
    [newurl_path_link] => Odkaz na newurlCMS
    [iduzel] => 67608
    [platne_od] => 15.12.2022 08:41:00
    [zmeneno_cas] => 15.12.2022 08:41:02.038458
    [zmeneno_uzivatel_jmeno] => Jan Kříž
    [canonical_url] => 
    [idvazba] => 81770
    [cms_time] => 1713620589
    [skupina_www] => Array
        (
        )

    [slovnik] => stdClass Object
        (
            [paticka_budova_c_nadpis] => BUDOVA C
            [preloader] => Prosím čekejte...
            [logo] => logo VŠCHT
            [logo_mobile_href] => /
            [logo_mobile] => logo VŠCHT
            [social_tw_odkaz] =>  
            [social_yt_odkaz] =>  
            [intranet_odkaz] =>  
            [intranet_text] =>  
            [mobile_over_nadpis_search] => Hledání
            [mobile_over_nadpis_login] => Přihlášení
            [aktualizovano] => Aktualizováno
            [autor] => Autor
            [paticka_budova_a_popis] => Rektorát, oddělení komunikace, pedagogické oddělení, děkanát FCHT, centrum informačních služeb
            [paticka_budova_b_nadpis] => BUDOVA B
            [paticka_budova_1_popis] =>  
            [paticka_budova_2_nadpis] => STUDENTSKÁ KAVÁRNA CARBON
            [zobraz_mobilni_verzi] => zobrazit responzivní verzi
            [social_li_odkaz] =>  
            [paticka_budova_c_popis] => Dětský koutek Zkumavka, praktický lékař, katedra ekonomiky a managementu, ústav matematiky
            [paticka_adresa] => VŠCHT Praha
Technická 5
166 28 Praha 6 – Dejvice
IČ: 60461373
DIČ: CZ60461373

Datová schránka: sp4j9ch

Copyright VŠCHT Praha
Za informace odpovídá Oddělení komunikace, technický správce Výpočetní centrum

VŠCHT Praha
na sociálních sítích [paticka_odkaz_mail] => mailto:info@vscht.cz [zobraz_desktop_verzi] => zobrazit plnou verzi [logo_href] => / [google_search] => [social_in_odkaz] => [social_fb_odkaz] => [mobile_over_nadpis_menu] => Menu [mobile_over_nadpis_jazyky] => Jazyky [menu_home] => Domovská stránka [paticka_mapa_odkaz] => https://www.vscht.cz/kontakt [paticka_budova_a_nadpis] => BUDOVA A [paticka_budova_b_popis] => Věda a výzkum, děkanát FTOP, děkanát FPBT, děkanát FCHI, výpočetní centrum, zahraniční oddělení, kvestor [paticka_budova_1_nadpis] => NÁRODNÍ TECHNICKÁ KNIHOVNA [paticka_budova_2_popis] => [drobecky] => [hledani_nadpis] => hledání [hledani_nenalezeno] => Nenalezeno... [hledani_vyhledat_google] => vyhledat pomocí Google [nepodporovany_prohlizec] => ) [poduzel] => stdClass Object ( [67609] => stdClass Object ( [obsah] => [poduzel] => stdClass Object ( [67610] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 67610 [canonical_url] => _clone_ [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) [67611] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 67611 [canonical_url] => _clone_ [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) [67612] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 67612 [canonical_url] => _clone_ [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) ) [iduzel] => 67609 [canonical_url] => _clone_ [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) [67613] => stdClass Object ( [obsah] => [poduzel] => stdClass Object ( [67614] => stdClass Object ( [nazev] => Národní institut virologie a bakteriologie [seo_title] => Úvodní stránka [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Národní institut virologie a bakteriologie (NIVB) sdružuje špičková vědecká pracoviště ze čtyř českých univerzit: Masarykovy univerzity, Univerzity Karlovy, Univerzity Palackého v Olomouci a Vysoké školy chemicko-technologické v Praze, a čtyř ústavů AVČR: Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i., Ústavu molekulární genetiky AV ČR, v. v. i., Mikrobiologického ústavu AV ČR, v. v. i., a Biologického centra AV ČR, v. v. i., jejichž výzkum je dlouhodobě etablován v oborech virologie a bakteriologie.

Vědecké zaměření konsorcia NIVB bude orientováno zejména na oblasti interakcí patogen-hostitel, imunity proti virům a bakteriím a léčby virových a bakteriálních onemocnění.

Projekt NIVB je financován z programu EXCELES, Programu podpory excelentního výzkumu v prioritních oblastech veřejného zájmu ve zdravotnictví v rámci Národního plánu obnovy.

Nově vzniklé pracoviště Národního institutu virologie a bakteriologie (NIVB) na VŠCHT se bude zabývat zejména základním výzkumem orientovaným k pochopení procesů a mechanismů, kterými vybraní zástupci retrovirů, flavivirů, koronavirů a patogenních bakterií interagují s hostitelskými buňkami, způsobují stávající i nová infekční onemocnění a odolávají léčbě. Výzkum bude zaměřen na popis interakcí virů a bakterií s hostitelem, pochopení molekulárního mechanismu patogeneze a vývoji protivirových a protibakteriálních látek.

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 67614 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_obrazek_vertical [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67615] => stdClass Object ( [nazev] => Vzorová stránka (1. úrovně) [seo_title] => Vzorová stránka (1. úrovně) [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [perex] =>

Při definování adresy na nejvyšší úrovni (tedy aby měla tato stránka adresu ***.vscht.cz/vzor, tedy hned za prvním lomítkem), je nutné v editaci v CMS adresu zadat včetně lomítka na začátku.

Pro podřízené stránky (na 2. a další úrovni) se adresa definuje bez začínajícího lomítka.

[ikona] => dokument-1 [obrazek] => [obsah] => [urlnadstranka] => [iduzel] => 67615 [canonical_url] => _clone_ [skupina_www] => Array ( ) [url] => /vzor [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_ikona [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67616] => stdClass Object ( [nazev] => Mapa webu [seo_title] => Mapa webu [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Zobrazuje se pouze ta část webu, která je v českém jazyce. Pokud má web i anglickou větev, přepněte na anglický jazyk v menu.

[urlnadstranka] => [obrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 67616 [canonical_url] => _clone_ [skupina_www] => Array ( ) [url] => /sitemap-cs_clone_16784 [sablona] => stdClass Object ( [class] => sitemap [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [48528] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 48528 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) ) [iduzel] => 67613 [canonical_url] => _clone_ [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) ) [sablona] => stdClass Object ( [class] => web [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) [api_suffix] => )

DATA


stdClass Object
(
    [nazev] => Národní institut virologie a bakteriologie
    [seo_title] => Úvodní stránka
    [seo_desc] => 
    [autor] => 
    [autor_email] => 
    [obsah] => 

Národní institut virologie a bakteriologie (NIVB) sdružuje špičková vědecká pracoviště ze čtyř českých univerzit: Masarykovy univerzity, Univerzity Karlovy, Univerzity Palackého v Olomouci a Vysoké školy chemicko-technologické v Praze, a čtyř ústavů AVČR: Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i., Ústavu molekulární genetiky AV ČR, v. v. i., Mikrobiologického ústavu AV ČR, v. v. i., a Biologického centra AV ČR, v. v. i., jejichž výzkum je dlouhodobě etablován v oborech virologie a bakteriologie.

Vědecké zaměření konsorcia NIVB bude orientováno zejména na oblasti interakcí patogen-hostitel, imunity proti virům a bakteriím a léčby virových a bakteriálních onemocnění.

Projekt NIVB je financován z programu EXCELES, Programu podpory excelentního výzkumu v prioritních oblastech veřejného zájmu ve zdravotnictví v rámci Národního plánu obnovy.

Nově vzniklé pracoviště Národního institutu virologie a bakteriologie (NIVB) na VŠCHT se bude zabývat zejména základním výzkumem orientovaným k pochopení procesů a mechanismů, kterými vybraní zástupci retrovirů, flavivirů, koronavirů a patogenních bakterií interagují s hostitelskými buňkami, způsobují stávající i nová infekční onemocnění a odolávají léčbě. Výzkum bude zaměřen na popis interakcí virů a bakterií s hostitelem, pochopení molekulárního mechanismu patogeneze a vývoji protivirových a protibakteriálních látek.

[submenuno] => [urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [newurl_domain] => 'nivb.vscht.cz' [newurl_jazyk] => 'cs' [newurl_akce] => '/home' [newurl_iduzel] => [newurl_path] => 8549/67607/67608/67613/67614 [newurl_path_link] => Odkaz na newurlCMS [iduzel] => 67614 [platne_od] => 15.12.2022 10:14:00 [zmeneno_cas] => 15.12.2022 10:20:54.194022 [zmeneno_uzivatel_jmeno] => Jan Prchal [canonical_url] => [idvazba] => 81776 [cms_time] => 1713620589 [skupina_www] => Array ( ) [slovnik] => Array ( ) [poduzel] => stdClass Object ( [67829] => stdClass Object ( [nazev] => Aktuality [seo_title] => Aktuality [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

CzechoSlovak Virology Conference, Prague, 15. - 16. 2. 2024

NIVB Networking meeting Brno 14. 9. 23

8th European Congress of Virology 2023, Gdansk, Polsko, 4. -7. 5. 2023
 

NIVB Networking meeting Prague 21. 8. 23

Harmonogram Seminářů NIVB

Jáchymov 2022

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [poduzel] => stdClass Object ( [77067] => stdClass Object ( [nazev] => 8th European Congress of Virology 2023 Gdansk [seo_title] => 8th European Congress of Virology 2023 Gdansk [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Virologické konference v polsku se zůčastnily: Markéta Častorálová, Karolína Burešová, Larisa Šinkovec, Ivana Křížová

 ◳ 20230506_175852 (edited 19.4.24 10:10:31) (png) → (šířka 450px)

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 77067 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/aktuality/77067 [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [77068] => stdClass Object ( [nazev] => CzechoSlovak Virology Conference [seo_title] => CSVC [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

15.-16. 2. 2024 Proběhla v Suchdole ČeskoSlovewnská virologická konference. S přednáškou Multiscale characterization of natural amino acid substitutions in RNA-dependent RNA polymerase of SARS-CoV-2 se zúčastnil Matěj Danda, s postery Karolína Burešová, Karolína Zvonařová a Alžběta Dostálková

. ◳ processed-1D8AF7DD-68D5-45CA-9F73-E5F669935F30 (jpg) → (šířka 450px)

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 77068 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/aktuality/77068 [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67845] => stdClass Object ( [nazev] => Jáchymov 2022 [seo_title] => Jáchymov 2022 [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

V termínu 9. - 11. 12. 2022 proběhlo neformální setkání členů virologické sekce NIVB VŠCHT ve školicím a ubytovacím zařízení VŠCHT v Jáchymově. 

 ◳ 318795624_469448405305123_483111905211661513_n (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ 318935865_630555968754686_6062644338202594016_n (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ 319230742_3296868923895048_2287169583401138323_n (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ IMG_20221210_103632 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ IMG_20221210_140308 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ IMG_20221210_140440 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ 20221210_125613 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ 20221210_103618 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ 20221210_105129 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ 20221210_131739 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ 20221210_155232 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ 20221210_155221 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ 20221210_095124 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ IMG_1688 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ IMG_1698 (1) (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ IMG_1690 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ IMG_1695 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ 20221210_161214 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ IMG_1701 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ 20221210_222212 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ 20221209_221002 (jpg) → (ořez 215*215px) ◳ 20221209_220929 (jpg) → (ořez 215*215px)

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 67845 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/aktuality/jachymov22 [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_galerie_velka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68462] => stdClass Object ( [nazev] => Harmonogram Seminářů NIVB [seo_title] => Harmonogram Seminářů NIVB [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

2024

10. 1. - virologie - Karolína Burešová

24. 1. - virologie - Karolína Zvonařová

25.-26. 1. - školení používání PEAQ-DSC

14. 2. - Nanoporové sekvenování - kolegové z Chile

21.2. - Michal H. Kolář

6.3. - D. Ondo, představení PEAQ-DSC

18.3. - Přednáška pana profesora Jada Forwooda na téma Structural Analysis of the MERS-CoV ORF4b Protein in Complex with Importins and its Role in Innate Immunity

3.4. - Přednáška pana profesora Pedra Cuadry z univerzity de Magallanes v Chile

2023

11. 1. Bakteriologie: Klonování bakteriálních efluxních pump - Dan Maxa Inhibice bakteriálních efluxních pump - Barča Křížkovská

18.1. Virologie: Chimery TBRV C a MPMP CA: Matěj Danda

25. 1. Bakteriologie: zrušeno

1.2. Virologie: SARS-CoV-2 RdRp: shrnutí IGRA projektu + dosavadní data v rámci NIVB: Anna Pavlů, Matěj Danda, Anna Klimešová

8.2. Bakteriologie: Quorum sensing u klinických izolátů rezistentních bakterií - Týnka Klementová Bakteriální ABCF ATPasa - Jakub Musil

16.2. Virologie: DHX15 a její role v replikačním cyklu MPMV ( a endogenních retrovirů???)

23.2 Bakteriologie:

2.3. Virologie: Příprava M-PMV RT

9.3. Bakteriologie:

16.3 Virologie: Odpadá

23.3. Bakteriologie:

30.3. Virologie: Interakce flavivirových proteinů s fosfolipidovou membránou a RNA

6.4. Bakteriologie:

13.4. Virologie:

20.4. Bakteriologie:

27.4. Virologie:

4.5. Bakteriologie:

11.5. Virologie:

18.5 Bakteriologie:

25.5 Virologie:

2.6. Bakteriologie

20.9. Virologie: Míša,Tomáš: sumarizace RAMM 2023

27.9. Bakteriologie:

11. 10. Virologie:

18. 10. Bakteriologie:

25.10. Virologie:

1.11. Bakteriologie:

8.11. Virologie:

6.12. Virologie: Danda - sestavení celého replikačního komplexu SARS-CoV-2

13.12. Bakteriologie:

2022

7.12. Bakteriologie: Markéta Čechová, NRL

14.12: Virologie: Karolína Zvonařová

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68462 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/aktuality/seminare [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67834] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 67834 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => slider [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) ) [iduzel] => 67829 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/aktuality [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67919] => stdClass Object ( [nazev] => Multirezistentní bakterie [seo_title] => Multirezistentní bakterie [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

V současné době celosvětová populace čelí post antibiotické éře, kdy většina antibiotik ztrácí schopnost účinně léčit bakteriální infekce. Vzhledem k tomu, že zavádění nových antibiotik do klinické praxe nedrží krok s rozvojem rezistence, jeví se adjuvantní (kombinovaná) terapie jako vhodná alternativa. Zajímá nás identifikace mechanismů rezistence u klinických izolátů Staphylococcus aureus a jejich cílená inhibice pomocí adjuvans. Pro tento účel konstruujeme knihovnu geneticky modifikovaných kmenů Escherichia coli, nesoucích jedinou determinantu rezistence. Tato determinanta obvykle představuje gen pro destruktasu, enzym, který modifikuje strukturu antibiotika. Takto připravené kmeny E. coli budou mít zvýšenou odolnost vůči působení antibiotika. Následně budou tyto kmeny použity pro vysoce výkonný screening knihovny látek, schopných vrátit fenotyp „rezistentní na antibiotika“ zpět na citlivý. Slibné sloučeniny budou následně testovány na jejich schopnost inhibovat rekombinantní, purifikovanou destruktasu.

Main mechanisms of bacterial drug resistance. 1. Bacterial multidrug efflux pumps: Transporters using the proton motive force to exclude antibiotics (ATB). 2. Decreased uptake: Limiting the influx of ATB by changing the permeability of membrane. 3. Inactivating enzymes (destructases): ATB elimination by e.g. phosphorylation, acetylation, adenylation. 4. Target alterations: Modification of target sites (e.g. ribosomes) to avoid recognition by ATB. 5. Bypass pathway: The adjustment of essential synthesis pathway that is normally inhibited by ATB.

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [poduzel] => stdClass Object ( [67958] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 67958 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => slider [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) ) [iduzel] => 67919 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/bakterie [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67918] => stdClass Object ( [nazev] => Koronaviry [seo_title] => Koronaviry [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Nový koronavirus SARS-CoV-2, který se objevil na konci roku 2019 ve Wu-chanu v Číně, způsobil globální propuknutí akutního respiračního onemocnění COVID-19, spojeného se smrtelným zápalem plic. Vzhledem k tomu, že SARS-CoV-2 kóduje vlastní proteiny podílející se na opravných mechanismech mutací, vznikajících během replikace viru, je použití nukleosidových analogů jako antivirotik pro léčbu COVID-19 značně limitované. My jsme se proto zaměřili na charakterizaci domnělých alosterických míst RNA-dependentní RNA polymerasy (RdRp) a screening vazebné aktivity malých sloučenin, které by interferovaly s alosterickou modulací RdRp. Předběžně jsme in silico vybrali místa RdRp, která se potenciálně podílejí na alosterické regulaci aktivity tohoto enzymu. Ta jsou testována a charakterizována kombinací strukturně-funkčních přístupů. Dále se zabýváme in vitro analýzou přirozeně se vyskytujících mutací v oblastech RdRp, jejichž výskyt souvisí s různými variantami SARS-CoV-2, které byly v posledních třech letech opakovaně hlášeny u RdRp kofaktorů (nsp7, nsp8 a nsp12). Dalším cílem naší studie SARS-CoV2 je exoribonukleasový komplex, zodpovědný za opravnou aktivitu SARS-CoV-2. Inhibice aktivity tohoto komplexu, skládajícího se z exoribonukleasové domény a jejího kofaktoru, se v rámci replikace virové RNA jeví jako slibný přístup ke zvýšení účinnosti aktivních inhibitorů RdRp.

Struktura RdRp komplexu SARS-CoV-2 (PDB ID: 7KRO) – NSP12 (béžová), NSP8 (fialová), NSP7 (modrá), templátový řetězec RNA (zelená), RNA produkt (oranžová), predikovaná alosterická místa v NSP12 (Barakat et al, 2020) (červená)Struktura exoribonukleázové domény NSP14 SARS-CoV-2 (ornažová) v komplexu s kofaktorem NSP10 (tyrkysová) (PDB ID: 7DIY)Průběh polymerázové reakce RdRp SARS-CoV-2 divokého typu (červená) a RdRp s přirozenou aminokyselinovou záměnou (modrá)

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [poduzel] => stdClass Object ( [67956] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 67956 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => slider [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) ) [iduzel] => 67918 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/koronaviry [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67917] => stdClass Object ( [nazev] => Flaviviry [seo_title] => Flaviviry [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Zástupci flavivirů, jako je virus dengue (DENV), virus západonilské horečky (WNV), virus Zika (ZIKV), virus žluté zimnice (YFV) a virus klíšťové encefalitidy (TBEV) jsou důležitými lidskými patogeny s celosvětovým dopadem na zdraví lidí a zvířat. Navzdory dostupnosti vakcíny proti TBEV, stále existuje potřeba léčby klíšťové encefalitidy. Náš výzkum je zaměřen na jeden ze slibných cílů pro antivirotika, flavivirový kapsidový (C) protein. C protein je nezbytný pro sestavení flavivirové nukleokapsidy, zřejmě mechanismem, kdy současně interaguje s virovou genomovou RNA a lipidovou membránou endoplasmatického retikula infikovaných buněk. Na základě naší nedávno publikované NMR struktury proteinu TBEV C, jsme se zaměřili na identifikaci oblastí a aminokyselinových zbytků TBEV C, zapojených do vazby s lipidovou membránou a virovou genomovou RNA. Získaná data by měla významně rozšířit naše znalosti o mechanismu a specificitě C proteinu v procesu balení vRNA při infekci TBEV a přispět tak k rozvoji cílené terapie.

3D struktura homodimeru Δ16-TBEVC vytvořená na základě naměřených dat z NMR spektroskopie a hmotností spektrometrie vodík-deuteriové výměny. A) Čárová reprezentace 20 dimerních struktur Δ16-TBEVC superponovaných přes těžké atomy páteře helixů α2-α4. B) Průměrná struktura homodimeru Δ16-TBEVC v cartoon reprezentaci. 1–boční pohled, 2–horní pohled a 3–přední pohled. Helixy jsou označeny jako α1-α4.

Porovnání homodimerních struktur kapsidového proteinu viru klíšťové encefalitidy (Δ16-TBEVC), viru dengue (Δ20-DENVC), viru zika (Δ25-ZIKVC) a viru západonilské horečky (Δ23-WNVC). První řádek každého pohledu představuje struktury proteinů v cartoon reprezentaci. Modrá-α1, oranžová-α2, zelená-α3 a červená-α4. Druhý řádek každého pohledu představuje struktury proteinů se zobrazeným povrchem. Kladně nabitá rezidua jsou zvýrazněna modře, záporně nabitá rezidua červeně a ostatní šedě. U Δ20-DENVC je vyznačena hydrofobní kapsa (horní pohled), která by se měla účastnit interakce s membránou endoplazmatického retikula, nicméně v ostatních strukturách není tak jasně definována, a kladně nabitý povrch (dolní pohled), který má být zodpovědný za vazbu virové genomové RNA a je společný všem strukturám.

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [poduzel] => stdClass Object ( [67954] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 67954 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => slider [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) ) [iduzel] => 67917 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/flaviviry [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67832] => stdClass Object ( [nazev] => Publikace [seo_title] => Publikace [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Bára Křížkovská, Lan Hoang, Daniela Brdová, Kristýna Klementová, Nikoletta Szemerédi, Anna Loučková, Olga Kronusová, Gabriella Spengler, Petr Kaštánek, Jana Hajšlová, Jitka Viktorová, Jan Lipov:  Modulation of the bacterial virulence and resistance by well-known European medicinal herbs, Journal of Ethnopharmacology, Volume 312, 2023, DOI

Tomáš Ruml: The Present and Future of Virology in the Czech Republic—A New Phoenix Made of Ashes? Viruses 2022, 14, 1303, DOI

Martin Selinger, Radim Novotný, Jakub Sýs, Justin A. Roby, Hana Tykalová, Ganji Sri Ranjani, Marie Vancová, Kateřina Jaklová, Filip Kaufman, Marshall E. Bloom, Zbyněk Zdráhal, Libor Grubhoffer, Jade K. Forwood, Richard Hrabal, Michaela Rumlová, Ján Štěrba:Tick-borne encephalitis virus capsid protein induces translational shutoff as revealed by its structural–biological analysis, Journal of Biological Chemistry,2022 298/11, DOI

Markéta Častorálová, Jakub Sýs, Jan Prchal, Anna Pavlů, Lucie Prokopová, Zina Briki, Martin Hubálek, Tomas Ruml: A myristoyl switch at the plasma membrane triggers cleavage and oligomerization of Mason-Pfizer monkey virus matrix protein, 2024 eLife 13:e93489, DOI
    

Matěj DandaAnna KlimešováKlára KuškováAlžběta DostálkováAneta PagáčováJan PrchalMarina KapishevaTomáš RumlMichaela Rumlová: Biochemical characterization of naturally occurring mutations in SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase, 2024 PREPRINTDOI

Michaela Rumlová, Alžběta Dostálková, Ivana Krizova et al. Unveiling the DHX15 - G-patch Interplay in Retroviral RNA Packaging, 2024, PREPRINT, DOI

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [poduzel] => stdClass Object ( [67836] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 67836 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => slider [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) ) [iduzel] => 67832 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/publications [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67831] => stdClass Object ( [nazev] => Vědecké zaměření NIVB na VŠCHT Praha [seo_title] => Vědecké zaměření NIVB na VŠCHT Praha [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Skupina NIVB na Vysoké škole chemicko-technologické v Praze se zaměřuje především na několik aspektů replikačního cyklu vybraných členů virů z čeledi Retroviridae, Flaviviridae a Coronaviridae a také na multirezistentní patogenní bakterie.

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [poduzel] => stdClass Object ( [67839] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 67839 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => slider [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) ) [iduzel] => 67831 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/topics [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67758] => stdClass Object ( [nazev] => Kontakty [seo_title] => Kontakty [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Klíčoví pracovníci

prof. Dr. Ing. Michaela Rumlová - vedoucí projektu

prof. Ing. Tomáš Ruml, CSc.

doc. Ing. Jitka Viktorová, PhD.

   

Zkušení výzkumní pracovníci

prof. Ing. Richard Hrabal, CSc.

doc. Ing. Jan Lipov, Ph.D.

Ing. Jan Prchal, Ph.D.

Ing. Daniel Ondo, Ph.D.

Ing. Markéta Častorálová, Ph.D.

Ing. Ivana Křížová

    

Postdoci

Ing. Alžběta Dostálková, Ph.D.

Mgr. Jana Racková, Ph.D.

Phd. Studenti

Ing. Larisa Šinkovec

Ing. Karolína Štrbová

Ing. Matěj Danda

Ing. Anna Klimešová

Ing. Karolína Zvonařová

Ing. Marina Kapisheva

Ing. Radim Novotný

Ing. Barbora Vokatá

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [poduzel] => stdClass Object ( [68182] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Markéta Častorálová, Ph.D [seo_title] => Ing. Markéta Častorálová, Ph.D [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

E-mail: Marketa.Landova@vscht.cz ◳ fotka na nástěnku 2 (jpg) → (šířka 215px)

Linka 5173 (tel. 220 445 173)

ORCID

Pracovní zkušenosti

2018 – současnost odborný asistent, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Ústav biochemie a mikrobiologie

2016 – 2018 Transformace, doplňování a validace dat o rostlinných extraktech – projekt OC/EFSA/SCER/2014/05, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze

2008 – 2012 odborný pracovník, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Ústav biochemie a mikrobiologie

Vzdělání

2007 – 2014 postgraduální studium, obor Mikrobiologie, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze

Téma disertační práce: Role proteinu SUMO v buněčné odpovědi na stres

2001 – 2007 magisterské studium, obor Obecná a aplikovaná biochemie, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, Vysoká škola chemicko-technologická v Praze

Téma diplomové práce: Možnosti užití sekvencí 16S a 23S rDNA pro diagnostiku patogenů

2005 letní semestr Technische Universität Carolo Wilhemina, Braunschweig, Něměcko

Studium v zahraničí v rámci programu Sokrates/Erasmus

Studijní obor: Biologie a biochemie

Zaměření v NIVB

Studium pozdní fáze životního cyklu retrovirů (M-PMV, HIV-1 a RSV) se zaměřením na maturaci.

Studium efluxních pump významných pro antibiotickou rezistenci u bakterií.

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68182 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/castoralova [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68488] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Barbora Vokatá [seo_title] => Ing. Barbora Vokatá [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Barbora.vokata@vscht.cz ◳ bara (jpg) → (šířka 215px)

Linka 5168

ORCID

Pracovní zkušenosti

2022-

Pedagogický pracovník ústavu biochemie a mikrobiologie, Vysoká škola chemicko-technologická

2021-

6 měsíční stáž: Max Planck Institute for Medical Research; Heidelberg

Financováno stipendiem: DAAD Research Grants – Short-Term Grants;

2018-

Vědecký pracovník ústavu biochemie a mikrobiologie, Vysoká škola chemicko-technologická

 

Vzdělání

2018-

Postgraduální studium:ústav biochemie a mikrobiologie, Vysoká škola chemicko-technologická. Studijní program: mikrobiologie

2015-2017

Magisterské studium: Ústav biochemie a mikrobiologie, Vysoká škola chemicko-technologická. Studijní program: mikrobiologie.

Zaměření NIVB

Virologie: produkce a purifikace virových proteinů. Transmisní elektronová mikroskopie.

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68488 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/vokata [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68485] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Marina Kapisheva [seo_title] => Ing. Marina Kapisheva [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Místnost:  A114, K04 ◳ marina (jpg) → (šířka 215px)

Telefon:

+420 22044 4166 (A114)

+420 22044 5004 (K04)

Email:

kapishea@vscht.cz

ORCID

Vzdělání

2016-2019 Bakalářské studium, VŠCHT Praha, Fakulta chemického inženýrství, Chemie

2019- 2021 Magisterské studium, VŠCHT Praha, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, Biotechnologie léčiv (Téma: Interaction of C protein with selected segments of Dengue genomic RNA)

Zaměření v NIVB

Produkce, izolace a purifikace rekombinantních proteinů

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68485 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/kapisheva [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68468] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Nikola Vrzáčková [seo_title] => Ing. Nikola Vrzáčková [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>
nikola.vrzackova@vscht.cz
Linka 5207
ORCID

Vzdělání:

2013-2016: Bakalářské studium na VŠCHT Praha, FPBT, Obor Forenzní analýza.
2016-2018: Magisterské studium na VŠCHT Praha, FPBT, Obor Laboratorní metody a příprava léčivých přípravků
2018- : Doktorské studium na VŠCHT Praha, FPBT, Obor Biochemie

Zaměření NIVB:

Konfokální a superrezoluční mikroskopie
[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68468 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/vrzackova [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68467] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Anna Pavlů [seo_title] => Ing. Anna Pavlů [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Anna.Pavlu@vscht.cz ◳ photo_2022 (jpg) → (šířka 215px)

Linka: 4166 (+420 220 444 166)

 Vzdělání a kvalifikace

2022 – : Vědecký pracovník na 2. Lékařské fakultě Univerzity Karlovy, Ústav bioinformatiky.
2015-2018: Bakalářské studium na VŠCHT Praha, FCHT, Obor Chemická informatika a bioinformatika.
 
2018-2020: Navazující magisterské studium na VŠCHT Praha, FCHT, Obor Chemická informatika a bioinformatika.
 
2020 – : Doktorské studium na VŠCHT Praha, FPBT, Obor Biochemie a bioorganická chemie. Zaměření na interakce virových proteinů s RNA a s buněčnými membránami.
 

Zaměření v NIVB

Retrovirová větev projektu: Studium protein-RNA interakcí v buněčných kulturách a in vitro. Návrh mutantních rekombinantních proteinů, jejich produkce a následné studium.
Koronavirová větev projektu: Návrh a testování potenciálních inhibitorů koronavirové RNA-polymerázy in vitro.
 
[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68467 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/pavlu [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68454] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Karolína Štrbová [seo_title] => Ing. Karolína Štrbová [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Tel.: 220 445 173 ◳ foto (png) → (šířka 215px)

 

Mail: strbovak@vscht.cz

 

Vzdělání a zkušenosti

2016-2019 Bakalářské studium, VŠCHT PRAHA, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, obor Biochemie a biotechnologie (téma BP: Studium denzních granul krevních destiček pomocí transmisní elektronové mikroskopie)

2019-2022 Magisterské studium, VŠCHT PRAHA, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, obor Biochemie a buněčná biologie (téma DP: Interakce matrixového proteinu Masonova-Pfizerova opičího viru s tRNA)

ERASMUS studijní pobyt LS 2020: University of Helsinky, Finsko

2022 – současnost Doktorské studium, VŠCHT PRAHA, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, obor Biochemie a bioorganická chemie (téma DP: Konformační změny retrovirových proteinů při interakci s membránami a jejich důsledky)

Zaměření v NIVB:

Virologie – produkce retrovirových částic v tkáňových kulturách, produkce a purifikace rekombinantních proteinů, mutageneze

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68454 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/strbova [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68414] => stdClass Object ( [nazev] => doc. Ing. Jan Lipov, Ph.D. [seo_title] => doc. Ing. Jan Lipov, Ph.D. [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

lipovj@vscht.cz ◳ xicht (jpg) → (šířka 215px)

 linka 4335 (tel. 220 444 335)

 ORCID

 Vzdělání a kvalifikace

10/2020 habilitace v oboru Biochemie

 2002

Krátkodobá stáž v laboratoři prof. Eric Hunter, University of Alabama, Birmingham, AL, USA

 2003 -

odborný pracovník/asistent/odborný asistent/docent, Ústav biochemie a mikrobiologie, VŠCHT Praha

1999–2006

postgraduální studium v oboru Chemie - Mikrobiologie, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, VŠCHT Praha

1994–1999

magisterské studium v oboru Obecná a Aplikovaná Biochemie - Biochemické inženýrství, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, VŠCHT Praha

 

Zaměření v NIVB

Virologie, mechanismy antibiotické rezistence, modulace bakteriální virulence

příprava veřejných zakázek na nákup přístrojů

 

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68414 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/lipov [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68378] => stdClass Object ( [nazev] => doc. Ing. Jitka Viktorová, Ph.D. [seo_title] => doc. Ing. Jitka Viktorová, Ph.D. [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

prokesoj@vscht.cz ◳ IMG_20190720_104459 (1) (jpg) → (šířka 215px)

linka 4335 (tel. 220 444 335)

ORCID 

Vzdělání a kvalifikace

10/2021 habilitace v oboru mikrobiologie, VŠCHT Praha

09/2009 – 03/2014 VŠCHT Praha, doktorské studium v oboru mikrobiologie

07/2010 Michigan State University, East Lansing, MI, USA

03/2015 – 04/2015 Vietnamese Universities excursions, Czech language teaching

11/2015 The Arctic University of Tromso, Norwegian College of Fishery Science, Tromso, Norway

06/2017 University of Vienna, Department of Pharmacology and Toxicology, Vienna, Austria

Zaměření v NIVB

Mechanismy antibiotické rezistence, modulace bakteriální virulence, inhibice tvorby biofilmu, inhibice mezibuněčné bakteriální komunikace, antimikrobiální aktivita

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68378 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/viktorova [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68360] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Matěj Danda [seo_title] => Ing. Matěj Danda [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

+420 220 444 127 ◳ foto (jpg) → (šířka 215px)

dandam@vscht.cz 

ORCID

Vzdělání a zkušenosti

2016-2019 Bakalářské studium, VŠCHT PRAHA, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, obor Biochemie a biotechnologie (Téma: Bakteriální degradace polycyklických aromatických uhlovodíků)

2019-2021 Magisterské studium, VŠCHT PRAHA, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, obor Biotechnologie a bioinženýrství (Téma: Příprava chimerních konstruktů pro studium vbalování RNA do virových částic)

2021- Doktorské studium, VŠCHT Praha, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, obor Biotechnologie

Zaměření v NIVB

Virologie – produkce, izolace a purifikace rekombinantních proteinů, mutageneze, mechanismus vbalování flavivirové RNA, studium RNA-dependentní RNA polymerázy SARS-CoV 2

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68360 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/danda [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68258] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Anna Klimešová [seo_title] => Ing. Anna Klimešová [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Anna.Klimesova@vscht.cz ◳ Image (jpg) → (šířka 215px)

linka 4127 (tel.: 220 444 127)

Vzdělání a kvalifikace

2022-dosud Doktorské studium, VŠCHT Praha, FPBT, obor Biotechnologie

2020-2022 Magisterské studium, VŠCHT Praha, FPBT, obor Biotechnologie léčiv (Ing.)

2017-2020 Bakalářské studium, VŠCHT Praha, FPBT, obor Biotechnologie léčiv (Bc.)

Zaměření v NIVB

Studium virových proteinů, studium aktivity RNA dependentní RNA polymerázy (RdRp) SARS-CoV-2, testování potenciálních inhibitorů RdRp

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68258 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/klimesova [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68169] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Alžběta Dostálková, Ph.D. [seo_title] => Ing. Alžběta Dostálková, Ph.D. [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

alzbeta.dostalkova@vscht.cz ◳ betka (png) → (originál)

linka 4166 (+420 220 444 166)

linka 4127 (+420 220 444 127)

ORCID

Vzdělání:

2015-2022 postgraduální studium, obor Mikrobiologie, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, VŠCHT Praha (téma: Studium interakcí vedoucích ke skládání retrovirových částic – nástroj pro inhibici jejich tvorby)

2013-2015 magisterské studium, obor Biotechnologie léčiv, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, VŠCHT Praha (téma: Vliv bazické oblasti nukleokapsidového proteinu na tvorbu zralé a nezralé retrovirové částice)

Pracovní zkušenosti:

2022 – dosud vědecký pracovník v laboratoři prof. Dr. Ing. Michaely Rumlové, VŠCHT Praha

2014 – stáž v laboratoři prof. Aleny Kubátové, UND, Severní Dakota, USA (4 měsíce)

Zaměření v NIVB

Studium skládání retrovirových částic a jejich organizace, rozpoznání a vbalování virové RNA do vznikajících virových částic, interakce virové RNA s hostitelskými a virovými proteiny, měření aktivity enzymů související se syntézou virové RNA.

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68169 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/dostalkova [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67906] => stdClass Object ( [nazev] => prof. Ing. Richard Hrabal, CSc. [seo_title] => prof. Ing. Richard Hrabal, CSc. [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

richard.hrabal@vscht.cz ◳ richard-200 (jpg) → (ořez 215*215px)

linka 3805 (tel. 220 443 805)

Orcid

Vzdělání a kvalifikace

 
2017
Jmenován profesorem biochemie, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, VŠCHT Praha.
2007
Habilitace v oboru biochemie, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, VŠCHT Praha.
1989
CSc. v oboru organická chemie, Fakulta chemické technologie VŠCHT Praha
1988
Postgraduální kurs "NMR spektroskopie v kapalné a pevné fázi", Fakulta chemickej technológie, Slovenská vysoká škola technická v Bratislavě
1982
Ing. v oboru organická chemie, Fakulta chemické technologie, VŠCHT Praha
Zaměstnání
 
2003–
vedoucí Centrálních laboratoří VŠCHT Praha
1996–
vedoucí Laboratoře NMR spektroskopie na VŠCHT Praha
1993–1996
Research Associate na Biotechnology Research Institute, div. Biomolecular Interactions. National Research Council of Canada, Montreal, Canada
1992–1993
vedoucí laboratoře NMR, VŠCHT Praha
1990
krátkodobý studijní pobyt na Inorganic Chemistry Department of the Oxford University, Prof. R.J.P. Williams (Study of binding zinc ion to short peptides)
1987–1992
odborný pracovník v NMR laboratoři
1986–1987
vědecký pracovník na Katedře organické chemie VŠCHT Praha

Zaměření v NIVB

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 67906 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/hrabal [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68066] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Radim Novotný [seo_title] => Ing. Radim Novotný [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

radim.novotny@vscht.cz ◳ Profilovka_Radim (png) → (šířka 215px)

linka 5173 (tel. 220 445 173)

ORCID

Vzdělání a kvalifikace

2018-

Doktorské studium v oboru Biochemie, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, VŠCHT Praha

2017-

Vědecký pracovník v laboratoři NMR spektroskopie, VŠCHT Praha

2016-2018

Magisterské studium v oboru Obecná a Aplikovaná Biochemie, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, VŠCHT Praha (téma: Hledání nových interakčních partnerů matrixového proteinu Masonova-Pfizerova opičího viru)

2012-2016

Bakalářské studium v oboru Biochemie a Biotechnologie, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, VŠCHT Praha (téma: Cytokompatibilita kovových slitin pro dočasné ortopedické aplikace)

Zaměření v NIVB

Studium struktur a interakcí kapsidových proteinů vybraných flavivirů s částmi virové genomové RNA a membránou endoplazmatického retikula. Preferenční zaměření na kapsidový protein viru klíšťové encefalitidy.

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68066 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/novotny [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68032] => stdClass Object ( [nazev] => prof. Ing. Tomáš Ruml, CSc. [seo_title] => prof. Ing. Tomáš Ruml, CSc. [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

 +420 220443022 ◳ truml (jpg) → (šířka 215px)
tomas.ruml@vscht.cz

ORCID

Vzdělání

 
2008 Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Ústav kvasné chemie a bioinženýrství
Kandidát biologických věd, Obor: Mikrobiologie
Disertační práce: Studium exkrece thiaminu u mutantů Saccharomyces cerevisiae
1973–1978 Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Ústav kvasné chemie a bioinženýrství
Obhajoba Ing. Obor: kvasné chemie a technologie
Diplomová práce: Fysiologické charakteristiky Candida utilis rostoucí na ethanolu

Pracovní zkušenosti

09/2013-08/2020 vedoucí Ústavu biochemie a mikrobiologie, VŠCHT, Praha
01/2012–12/2019 děkan FPBT VŠCHT, Praha
2009/2011 prorektor pro zahraničí - VŠCHT, Praha
2006/2009 proděkan pro vědu a výzkum FPBT VŠCHT, Praha
12/2002 – dosud profesor, Ústav biochemie a mikrobiologie - VŠCHT, Praha
01/1996 – dosud docent, Ústav biochemie a mikrobiologie - VŠCHT, Praha
09/1984 odborný asistent, Ústav biochemie a mikrobiologie - VŠCHT, Praha
[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68032 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/ruml [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68029] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Daniel Ondo, PhD. [seo_title] => Ing. Daniel Ondo, PhD. [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Daniel.Ondo@vscht.cz ◳ ondod (jpg) → (šířka 215px)

linka 3828 (tel. 220 443 828)

ORCID

Vzdělání a kvalifikace

2014 -

odborný asistent, Ústav fyzikální chemie, VŠCHT Praha

04/2013 – 09/2013

postdoktorandský pobyt, Fakulta mechanického a chemického inženýrství, TU Kaiserslautern, Německo

02/2012 – 01/2013

postdoktorandský pobyt, Fakulta chemie, Národní autonomní univerzita Mexika (UNAM), Mexiko

04/2011 – 01/2012

vědecký asistent, Ústav fyzikální chemie, VŠCHT Praha

2007–2013

postgraduální studium v oboru Fyzikální chemie, Fakulta chemicko-inženýrská, VŠCHT Praha (téma: Thermodynamic Study of Interactions Between Ionic Liquids, Their Precursors and Cyclodextrins in Aqueous Solutions)

2000–2006

magisterské studium v oboru Fyzikální chemie, Fakulta chemicko-inženýrská, VŠCHT Praha (téma: Limiting Activity Coefficients and Henry’s Law Constants of Selected Volatile Oxygenates in Water)

Zaměření v NIVB

Studium interakcí proteinů, izotermální titrační kalorimetrie (ITC), diferenciální skenovací kalorimetrie (DSC), správa webu NIVB

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68029 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/ondo [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [68017] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Karolína Zvonařová [seo_title] => Ing. Karolína Zvonařová [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Karolina.Zvonarova@vscht.cz

Linka: 4166 (+420 220 444 166)

Vzdělání a kvalifikace

2022- Doktorské studium, VŠCHT Praha, FPBT, Mikrobiologie

2020-2022 Magisterské studium, VŠCHT Praha, FPBT, Mikrobiologie a genové inženýrství (Ing.)

2017-2020 Bakalářské studium, VŠCHT Praha, FPBT, Biochemie a biotechnologie (Bc.)

Zaměření v NIVB

Testování inhibitorů tvorby retrovirových částic „cell based“ a „in vitro“, studium interakce inhibitorů a jejich vlivu na skládání virových částic, imunochemické testy, studium virových proteinů, výuka laboratoří

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 68017 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/zvonarova [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67912] => stdClass Object ( [nazev] => prof. Dr. Ing. Michaela Rumlová [seo_title] => prof. Dr. Ing. Michaela Rumlová [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

michaela.rumlova@vscht.cz ◳ MR5 (jpg) → (šířka 215px)

linka 4177 (220 444 177)

ORCID

Vzdělání

1992 Vysokoškolské studium VŠCHT Praha, specializace Enzymové inženýrství, Diplomová práce: Inhibitory HIV-1 a HIV-2 proteas

1996 Doktorské studium VŠCHT Praha, Dizertační práce: Study and expression of Mason-Pfizer monkey virus proteins

2018 Habilitace, jmenování docentkou pro obor Biotechnologie

2021 Jmenování profesorem pro obor Biotechnologie

Pracovní zkušenosti

1993 University of Alabama at Birmingham (UAB), USA; (3 měsíce)

1994 University of Alabama at Birmingham (UAB), USA; (3 měsíce)

1996-7 University of Alabama at Birmingham (UAB), USA; (1 rok)

1998 University of Alabama at Birmingham (UAB), USA; (3 měsíce)

1997-2014 vědecký pracovník, Ústav organické chemie a biochemie v.v.i., Akademie věd ČR

2013-2018 odborný asistent, VŠCHT Praha, Ústav biotechnologie

2018 docent, VŠCHT Praha, Ústav biotechnologie

2021 profesor VŠCHT Praha, Ústav biotechnologie

Zaměření v NIVB

Principy formování retrovirových částic, jejich strukturní organizace a možnosti inhibice; interakce mezi virovými a buněčnými proteiny a nukleovými kyselinami; strukturní a funkční aspekty C proteinů viru klíšťové encefalitidy, Dengue a Zika; alosterická místa RNA polymerasy SARS-CoV-2 a jejich inhibice.

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 67912 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/rumlova [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67909] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Larisa Šinkovec [seo_title] => Ing. Larisa Šinkovec [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Místnost: ◳ Sinkovec (png) → (šířka 215px)

A115, K04

Telefon:

+420 22044 4127 (A115)

+420 22044 5004 (K04)

Email:

larisa.sinkovec@gmail.com sinkovel@vscht.cz

Vzdělání a kvalifikace

2015-2019 2018- 2019 Bakalářské studium, Biotechnická fakulta, Lublaň, Mikrobiologie (Bc.) Odborná stáž, Laboratoř molekulární biologie bakteriálních patogenů, Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

2020-

2022 Magisterské studium, VŠCHT Praha, FPBT, Biotechnologie a potravinářství (Ing.)

Od 2022 Doktorské studium, VŠCHT Praha, FPBT, Biotechnologie

Zaměření v NIVB

Vyšetření a studium retroviru MPMV, charakterizace reverzní transkriptázy a její aktivity in vitro, studium interakcí mezi retrovirovými doménami a nukleovými kyselinami.

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 67909 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/sinkovec [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67893] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Ivana Křížová [seo_title] => Ing. Ivana Křížová [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

ivana.krizova@vscht.cz ◳ Ivana (jpg) → (ořez 215*215px)

linka 4127, 5004 (tel. 220 444 127, 220 445 004)

Orcid

Vzdělání a kvalifikace

2017- Doktorské studium, VŠCHT Praha, FPBT, Ústav biotechnologie (téma: Studium funkce glycin-bohaté domény v životním cyklu Mason-Pfizerova opičího viru)

2016- VŠCHT Praha, Ústav biotechnologie, odborný pracovník

1993-2017 UOCHB AV ČR, odborný pracovník vědy a výzkumu

1989-1993 Magisterské studium, VŠCHT Praha, FPBT, obor Enzymové inženýrství, Ústav biochemie a mikrobiologie (Ing.)

Zaměření v NIVB

Studium virových proteinů, testování inhibitorů tvorby retrovirových částic, průtoková cytometrie, správa projektu

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 67893 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/krizova [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67762] => stdClass Object ( [nazev] => Ing. Jan Prchal, PhD. [seo_title] => Ing. Jan Prchal, PhD. [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

 jan.prchal@vscht.cz

 ◳ y8jPq0os0DUyMAAA (1) (jpg) → (šířka 215px)

linka 3840 (tel. 220 443 840)

linka 5173 (tel. 220 445 173)

ORCID

Vzdělání a kvalifikace

2014
Krátkodobá stáž v laboratoři Dr. Delphine Muriaux, CPBS, CMRS, Montpellier
, Francie
2010-
vědecký pracovník v laboratoři NMR spektroskopie, VŠCHT Praha
2007–2013
postgraduální studium v oboru Biochemie, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, VŠCHT Praha (téma: Studie interakce mat
rixového proteinu Masonova-Pfizerova opičího viru s cytoplasmatickou membránou)
2002–2007
magisterské studium v oboru Obecná a Aplikovaná Biochemie, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, VŠCHT Praha (téma: Studium struktury mutantu T41I/T78I matrixového proteinu Mason-Pfizerova opičího viru)

Zaměření v NIVB

Virologie, studium interakcí proteinů, termoforéza, NMR spektroskopie, produkce rekombinantních proteinů, správa webu NIVB

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 67762 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts/prchal [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67841] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 67841 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => slider [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) ) [iduzel] => 67758 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/contacts [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67757] => stdClass Object ( [nazev] => Přístrojové vybavení [seo_title] => Přístrojové vybavení [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] => [urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [poduzel] => Array ( ) [iduzel] => 67757 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/equipment [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67737] => stdClass Object ( [nazev] => Retroviry [seo_title] => Retroviry [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Rozpad retrovirového core po vstupu do hostitelské buňky je oblastí velkého vědeckého zájmu. Nedávné zjištění, že intaktní kapsida HIV-1 prostupuje jadernými póry do jádra infikovaných buněk, vrhlo na tento proces zcela nové světlo. Kombinací analýzy cryoEM, MS a iCLIP zkoumáme několik aspektů procesu disociace retrovirového core, včetně zapojení hostitelských kofaktorů.

Zajímá nás také maturace, neboli štěpení retrovirového strukturního polyproteinu Gag, jejíž přesný postup je zcela kritický pro správné vytvoření zralé, plně infekční virové částice. Věnujeme se jednak poslednímu kroku maturace HIV-1, tedy odštěpení krátkého peptidu (SP1) z C-konce kapsidového proteinu (CA). Tento krok je inhibován maturačními inhibitory, jejichž nové deriváty testujeme kombinací buněčných a in vitro metod. Další oblastí našeho zájmu je také první krok samotné maturace Mason-Pfizerova opičího viru (M-PMV) a s ním spojené strukturní změny, které tento proces reorganizace retrovirové částice doprovázejí. Naše nová strukturní data ukázují, že interakce matrixové domény (MA) M-PMV s plazmatickou membránou vedou k expozici kotranslačně připojeného myristoylu, a tato změna konformace následně významně ovlivňuje počáteční krok maturace, a může tak představovat kontrolní prvek v sekvenčním štěpení polyproteinu Gag.

 Model of the CT complex with a trimeric MA. (A) MA-CT38 complex calculated in HADDOCK based on NMR results. (B) Model of the MA-CT complex created based on HADDOCK calculation (the C-terminal part of the CT38) and the results of XL-MS (the N-terminal part of the CT), where the N-terminal part of the CT sequence was twisted around the MA to meet the restrains determined by identified cross-links. Trimeric MA (30) is shown in the surface representation (A) or in the cartoon representation with a transparent surface (B), and single MA monomers are colored in different shades of gray. The MA residues identified by NMR spectroscopy as interacting with the CT38 are colored blue, and the MA residues forming cross-links with the CT38 residues are colored red. CT38 is shown in ribbon with mesh surface representation colored violet. The CT38 residues identified by NMR as interacting with the MA are colored, cyan and the CT38 residues forming cross-links with MA residues are colored black. The cross-links are displayed as dashed lines. The plasma membrane is depicted as a full line to express the orientation of the MA-CT38 complex on the membrane.Schematic model of the organization of MA and CT trimers at the membrane (a view from the inner side of the membrane). MA trimers and CT38 molecules are shown in surface representation. Single MA monomers are colored in different shades of gray, and CT38 is colored violet. Six MA molecules of individual MA trimers form a hexameric structure, with three MA trimers in complex with three individual CT38 domains of the M-PMV TM Env trimer anchored in the plasma membrane.

Surface mapping of Mouse mammary tumor virus MA  A) Interactions in the sequence of MMTV MA bound to liposomes mimicking phospholipid composition of inner leaflet of plasma membrane containing PC, PE, PS, PI4,5P2 in molar ratio of 45:45:5:5 (PC/PE/PS/PI4,5P2), and protein bound to liposomes comprised of PC and PS in molar ratio of 66:34 (PC/PS).  B) Residues of MMTV MA visualized in the snapshots obtained by GC-MD simulations. The snapshots are presented in to different side-views. Accessible residues are colored in green, inaccessible residues in red, myristoyl in orange, PS in cyan and PI4,5P2 in yellow.  Junkova, P et al., Differences and commonalities in plasma membrane recruitment of the two morphogenetically distinct retroviruses HIV-1 and MMTV. J. Biol. Chem. 2020 Jun 26;295(26):8819-8833. doi: 10.1074/jbc.RA119.011991. Epub 2020 May 8.a) Scheme of used constructs; electrophoretic verification of purity of bacterially produced proteins; TEM analysis of in vitro assembled particles; structures of used polyanions  b) Assembly efficiency of HIV-1 d16-99MACASP1NCSP2 wt protein in the presence of polyanions at indicated protein hexamer : PA ratios.  c) Fluorescence emission curves demonstrating the effect of polyanions on the kinetics of tqON degradation (the colors of the curves corresponding to the polyanions are the same as those in panel b)  Dostálková A. et al., In vitro quantification of the effects of IP6 and other small polyanions on immature HIV-1 particle assembly and core stability. J Virol. (2020) 94 (20): e00991-20, doi: 10.1128/JVI.00991-20.Colocalization of M-PMV transmembrane domain of mCherry labeled Env glycoprotein (red) with Golgi marker (green) in COS-1 cells. The samples were imaged with spinning disk confocal microscope (Andor) at magnification 600x   Grznárová Prokšová P. et al., Mason-Pfizer Monkey Virus Envelope Glycoprotein Cycling and Its Vesicular Co-Transport with Immature Particles. Viruses (2018), 10(10), 575; doi:10.3390/v10100575a) The arrangement of the CA lattices in immature M-PMV and immature and mature HIV-1 particles.  CA-NTD and CA-CTD domains - in cyan/blue and orange/red, respectively.  b) Top and orthogonal views of the structures of CA dimers from the lattices.  Schur F. et al., The structure of the immature HIV-1 capsid in intact virus particles at 8.8 Å resolution. Nature (2015) 517, 505–508, doi:10.1038/nature13838

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [poduzel] => stdClass Object ( [67843] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 67843 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => slider [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) ) [iduzel] => 67737 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home/retroviry [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [67717] => stdClass Object ( [obsah] => [poduzel] => stdClass Object ( [67718] => stdClass Object ( [nadpis] => [popis] => [platne_od] => [platne_do] => [odkaz] => [text_odkazu] => [obrazek_pozadi] => 0002~~8_MMc1IoSc0tyEksSQUA.jpg [barva_textu] => [iduzel] => 67718 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => slider [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) ) [iduzel] => 67717 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => slider [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 0 ) ) ) [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_obrazek_vertical [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) [api_suffix] => )

VŠCHT Praha
Technická 5
166 28 Praha 6 – Dejvice
IČ: 60461373
DIČ: CZ60461373

Datová schránka: sp4j9ch

Copyright VŠCHT Praha
Za informace odpovídá Oddělení komunikace, technický správce Výpočetní centrum

VŠCHT Praha
na sociálních sítích
zobrazit plnou verzi