Prosím čekejte...
Nepřihlášený uživatel
logo VŠCHT
 → Úvodní stránka → Flaviviry

Flaviviry

Zástupci flavivirů, jako je virus dengue (DENV), virus západonilské horečky (WNV), virus Zika (ZIKV), virus žluté zimnice (YFV) a virus klíšťové encefalitidy (TBEV) jsou důležitými lidskými patogeny s celosvětovým dopadem na zdraví lidí a zvířat. Navzdory dostupnosti vakcíny proti TBEV, stále existuje potřeba léčby klíšťové encefalitidy. Náš výzkum je zaměřen na jeden ze slibných cílů pro antivirotika, flavivirový kapsidový (C) protein. C protein je nezbytný pro sestavení flavivirové nukleokapsidy, zřejmě mechanismem, kdy současně interaguje s virovou genomovou RNA a lipidovou membránou endoplasmatického retikula infikovaných buněk. Na základě naší nedávno publikované NMR struktury proteinu TBEV C, jsme se zaměřili na identifikaci oblastí a aminokyselinových zbytků TBEV C, zapojených do vazby s lipidovou membránou a virovou genomovou RNA. Získaná data by měla významně rozšířit naše znalosti o mechanismu a specificitě C proteinu v procesu balení vRNA při infekci TBEV a přispět tak k rozvoji cílené terapie.

3D struktura homodimeru Δ16-TBEVC vytvořená na základě naměřených dat z NMR spektroskopie a hmotností spektrometrie vodík-deuteriové výměny. A) Čárová reprezentace 20 dimerních struktur Δ16-TBEVC superponovaných přes těžké atomy páteře helixů α2-α4. B) Průměrná struktura homodimeru Δ16-TBEVC v cartoon reprezentaci. 1–boční pohled, 2–horní pohled a 3–přední pohled. Helixy jsou označeny jako α1-α4.

Porovnání homodimerních struktur kapsidového proteinu viru klíšťové encefalitidy (Δ16-TBEVC), viru dengue (Δ20-DENVC), viru zika (Δ25-ZIKVC) a viru západonilské horečky (Δ23-WNVC). První řádek každého pohledu představuje struktury proteinů v cartoon reprezentaci. Modrá-α1, oranžová-α2, zelená-α3 a červená-α4. Druhý řádek každého pohledu představuje struktury proteinů se zobrazeným povrchem. Kladně nabitá rezidua jsou zvýrazněna modře, záporně nabitá rezidua červeně a ostatní šedě. U Δ20-DENVC je vyznačena hydrofobní kapsa (horní pohled), která by se měla účastnit interakce s membránou endoplazmatického retikula, nicméně v ostatních strukturách není tak jasně definována, a kladně nabitý povrch (dolní pohled), který má být zodpovědný za vazbu virové genomové RNA a je společný všem strukturám.

Aktualizováno: 20.1.2023 08:29, Autor: Jan Prchal

VŠCHT Praha
Technická 5
166 28 Praha 6 – Dejvice
IČ: 60461373
DIČ: CZ60461373

Datová schránka: sp4j9ch

Copyright VŠCHT Praha
Za informace odpovídá Oddělení komunikace, technický správce Výpočetní centrum

VŠCHT Praha
na sociálních sítích
zobrazit responzivní verzi