Nový koronavirus SARS-CoV-2, který se objevil na konci roku 2019 ve Wu-chanu v Číně, způsobil globální propuknutí akutního respiračního onemocnění COVID-19, spojeného se smrtelným zápalem plic. Vzhledem k tomu, že SARS-CoV-2 kóduje vlastní proteiny podílející se na opravných mechanismech mutací, vznikajících během replikace viru, je použití nukleosidových analogů jako antivirotik pro léčbu COVID-19 značně limitované. My jsme se proto zaměřili na charakterizaci domnělých alosterických míst RNA-dependentní RNA polymerasy (RdRp) a screening vazebné aktivity malých sloučenin, které by interferovaly s alosterickou modulací RdRp. Předběžně jsme in silico vybrali místa RdRp, která se potenciálně podílejí na alosterické regulaci aktivity tohoto enzymu. Ta jsou testována a charakterizována kombinací strukturně-funkčních přístupů. Dále se zabýváme in vitro analýzou přirozeně se vyskytujících mutací v oblastech RdRp, jejichž výskyt souvisí s různými variantami SARS-CoV-2, které byly v posledních třech letech opakovaně hlášeny u RdRp kofaktorů (nsp7, nsp8 a nsp12). Dalším cílem naší studie SARS-CoV2 je exoribonukleasový komplex, zodpovědný za opravnou aktivitu SARS-CoV-2. Inhibice aktivity tohoto komplexu, skládajícího se z exoribonukleasové domény a jejího kofaktoru, se v rámci replikace virové RNA jeví jako slibný přístup ke zvýšení účinnosti aktivních inhibitorů RdRp.
